Создан алгоритм для определения отцовских и материнских генов

Профессор биоинформатики Саарского университета Тобиас Маршалл и его коллеги из группы «Алгоритмы вычислительной геномики» в Центре биоинформатики занимаются разработкой вычислительных методов, которые делают массивы генетических данных управляемыми. Они разработали специальное программное обеспечение, которое позволяет вычислить, какие варианты генов были унаследованы от отца, а какие — от матери.

Программа получила название «WhatsHap», от haplotype — набора генов, полученного от одного из родителей.

«У людей 46 хромосом, — объясняет профессор Маршалл. — Но только 23 хромосомы включены в мужские и женские зародышевые клетки, которые затем соединяются в яйцеклетке и формируют новую жизнь. Такой полураспад хромосом называется „гаплотипом“».

По словам Маршалла, точные данные о вариантах генов, полученных от отца или матери, помогут предсказать вероятность тех или иных заболеваний и обеспечат их лучшее лечение.

Он убежден, что в обозримом будущем определение гаплотипа станет обычным обследованием в больницах — таким же, как анализ крови. «Определение генов одного из родителей похоже на решение чрезвычайно трудной загадки, — говорит он. — С WhatsHap мы можем определить гены обоих, причем одновременно».

Немецкий исследовательский фонд (DFG) объявил о финансовой поддержке проектов, связанных с WhatsHap, в размере €800 тыс. Большая часть средств будет направлена в Саарский университет для создания новых должностей для исследователей и разработчиков.

Шесть фармацевтических компаний Великобритании объявили о намерении расшифровать геном 500 тыс. британцев к 2020 году. Революционность проекта в том, что результаты исследований сделают общедоступными.

Данные ДНК анонимны, но с их помощью ученые могут изучить генетическую основу самых разных медицинских проблем: от диабета и рака до зависимости от видеоигр.